醫(yī)學系是學院于2015年成立的教學系，與護理系暫按“兩個牌子，一套班子”運行。醫(yī)學系現(xiàn)有教職工110余人，開設有臨床醫(yī)學、中醫(yī)學、康復治療技術、醫(yī)學檢驗技術專業(yè)，在校生達1000余人。設置有人體解剖、生理生化、病理免疫、中醫(yī)、康復、內科、外科、婦兒等教研室。

　　高職臨床醫(yī)學專業(yè)是國家教育部國控專業(yè)，我院成功設置高職臨床醫(yī)學專業(yè)，開辟了樂山醫(yī)學教育新紀元，更是學院醫(yī)學類專業(yè)辦學的重大突破和重要里程碑，對解決基層醫(yī)療機構醫(yī)學人才缺乏，促進樂山市及周邊市(州)基層醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展，具有重大意義。

　　推進醫(yī)教融合、協(xié)同育人。與區(qū)域醫(yī)療衛(wèi)生機構緊密合作，共育人才，形成了“院校融通、做學教一體、實境育人”的人才培養(yǎng)模式。搭建醫(yī)教融合合作平臺，于2018年建立了醫(yī)教聯(lián)盟，樂山職業(yè)技術學院、樂山市人民醫(yī)院、樂山市中醫(yī)院、樂山市婦幼保健院、武警四川省總隊醫(yī)院、四川現(xiàn)代醫(yī)院、眉山市心腦血管病醫(yī)院、樂山市市中區(qū)人民醫(yī)院、犍為縣人民醫(yī)院、馬邊彝族自治縣人民醫(yī)院、峨邊彝族自治縣人民醫(yī)院、峨眉山口腔醫(yī)院、四川省食品藥品學校、四川省質量技術監(jiān)督學校、樂山市旅游學校等均為聯(lián)盟成員。建有包括四川大學華西醫(yī)院、四川大學華西口腔醫(yī)院、四川省人民醫(yī)院、中國人民解放軍西部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院、樂山市人民醫(yī)院、武警四川省總隊醫(yī)院、天津市第一中心醫(yī)院、重慶市人民醫(yī)院等在內的70個校外實習基地，實現(xiàn)了實習與就業(yè)聯(lián)動。2014年樂山市第四人民醫(yī)院整體劃轉并入學院，成為樂山職業(yè)技術學院附屬醫(yī)院，并于2019年獲評國家級醫(yī)學臨床生產性實訓基地。

　　醫(yī)學系以學院師資隊伍建設工程為抓手，外引內培，努力提升教師綜合素質，優(yōu)化教學團隊結構?，F(xiàn)有專業(yè)課專任教師97人，其中教授、主任醫(yī)師16人，副教授、副主任醫(yī)師30人，博士2人，碩士研究生62人，雙師素質比例達到90%以上;有全國優(yōu)秀教師2人、樂山市學術與技術帶頭人7人、樂山市學術與技術帶頭人后備人選4人、樂山市技能標兵1 人，技術能手 2 人。從行業(yè)聘請兼職教師60余人，教師進醫(yī)院開展醫(yī)療服務20余人，實現(xiàn)了教學、臨床雙向流動。

　　2019年為地方政府承擔社會服務培訓13000余人次、技能鑒定900余人次，常年承擔各級各類成人學歷教育2000余人。共主持省級課題14項，市級課題20項;主編教材38本(其中4本被評為國家“十二五”規(guī)劃教材)，發(fā)表546篇公開論文(其中核心68篇)。近三年獲省級教學成果二等獎1項、省廳級科研成果三等獎2項、市級科技進步二等獎1項，市級科技論文一等獎4項、二等獎7項、三等獎3項，市級社科成果獎三等獎1項。

　　按照臨床工作過程和真實環(huán)境打造校內實訓基地，目前有專業(yè)實訓樓2幢，專業(yè)實訓室110間，實驗(訓)室面積達1.2萬余平方米，包括基礎醫(yī)學實訓區(qū)、臨床實訓區(qū)、中醫(yī)學實訓區(qū)、康復技能實訓區(qū)，確保實驗與實訓開出率達100%，做到了校內教學與臨床工作過程的有機對接

　　學院將進一步加大對醫(yī)學系辦學經費的投入，以加強醫(yī)教合作、隊伍建設、專業(yè)課程建設和實訓基地建設。

　　醫(yī)學系將在學院黨政的領導下，以教育部等六部門“關于醫(yī)教協(xié)同深化臨床醫(yī)學人才培養(yǎng)改革的意見”(教研[2014]2號)為指導，開拓進取，加強辦學條件建設，加強醫(yī)教合作，深化教學改革，準確定位人才培養(yǎng)目標，緊密對接基層衛(wèi)生崗位能力需求，優(yōu)化課程設置，實施并創(chuàng)新“醫(yī)教結合、做學一體、實境育人”的人才培養(yǎng)模式，努力培養(yǎng)“下得去、留得住、用得上”的高素質技術技能型基層衛(wèi)生人才，為樂山市及周邊市(州)基層衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展提供人才支撐。